科乐美发布的《合金装备大师合集1》在PC上的适配问题备受诟病。尤其是《合金装备3》在操作上没有对鼠标进行优化，而是简单地模拟手柄摇杆，而且无法调整光标速度，给玩家带来了很多不便。
除了操作问题，游戏的画面表现也存在一些不足。三款游戏的原始分辨率为720P，科乐美将输出分辨率提升到了1080P，但结果却令人失望。然而，令人欣慰的是，在游戏发布几个小时后，一些作者为游戏开发了分辨率提升补丁。这些补丁通过修改ini配置文件来改变分辨率，最高可实现4k分辨率运行。然而，使用这些补丁可能会导致界面错误，不过相信未来会有更完善的补丁出现。
