在《逃离鸭科夫》中，玩家若想达成游戏结局，有一个核心前提必须满足 —— 完成小明和杰夫的所有主线任务，这是开启任何结局分支的基础，若未完成这两位 NPC 的主线任务，将无法触发结局相关剧情。而最终会走向哪个结局，主要由两个关键选择决定：一是是否前往风暴区左侧获取飞船图纸并升级飞船，二是是否前往地图右上角关闭防空导弹，这两个选择的不同组合，构成了游戏的结局分支，虽然游戏显示有四个结局分支成就，但本质上可归为 “结局 0” 和 “结局 1” 两大结局类型。
先来看 “结局 0 分支”，这类结局的核心特征是 “未升级飞船”，最终玩家会被留在基地，具体包含 “幸存者” 和 “第九区” 两个分支成就。
第一个分支成就为 “幸存者”，其达成条件有三项。首先，必须完成小明与杰夫的所有主线任务，这是触发结局的基础;其次，在整个游戏进程中，不要前往风暴区获取飞船图纸，也不进行任何与飞船升级相关的操作，保持飞船的初始状态;最后，在飞船准备起飞的关键时刻，不进行任何干预，让防空导弹保持开启状态。满足这些条件后，最终结果会是：飞船因初始载人量有限，无法带上所有人员，只能将玩家留在基地，随后飞船起飞，但很快就被开启的防空导弹击中坠毁，而留在地面的玩家则得以安然无恙，达成 “幸存者” 结局。
第二个分支成就为 “第九区”，其达成条件同样以 “完成小明与杰夫的所有主线任务” 和 “不获取风暴区飞船图纸、不升级飞船” 为基础，但在防空导弹的处理上与 “幸存者” 结局相反。玩家需要在飞船起飞之前，主动前往地图右上角的防空导弹控制区域，关闭防空导弹系统 —— 这里需要注意，关闭防空导弹需要特定道具，即风暴区中心 BOSS 掉落的密钥，若未击败该 BOSS 获取密钥，将无法完成关闭操作。完成这些步骤后，最终结果是：飞船没有被防空导弹攻击，成功突破封锁逃离，但由于未升级飞船，载人量不足，玩家依然被独自留在了基地，从而达成 “第九区” 结局。
再来看 “结局 1 分支”，这类结局的核心特征是 “已升级飞船”，最终玩家有机会成功登上飞船，具体包含 “移动靶” 和 “逃离鸭科夫” 两个分支成就。
第一个分支成就为 “移动靶”，其达成条件首先仍是 “完成小明与杰夫的所有主线任务”;其次，玩家需要主动前往风暴区左侧，在指定位置使用移动硬盘下载飞船图纸，下载完成后，还需继续推进后续相关任务，为飞船安装空间扩展组件，完成飞船升级，使其具备容纳更多人员的能力;最后，在飞船起飞时，不关闭防空导弹，保持其开启状态。满足这些条件后，最终结果是：玩家成功登上升级后的飞船，但飞船在起飞过程中被开启的防空导弹锁定并击中，最终坠毁，船上全员遇难，达成 “移动靶” 结局。
第二个分支成就，也是游戏的 “真结局”——“逃离鸭科夫”，其达成条件最为全面。首先，必须完成小明与杰夫的所有主线任务;其次，需前往风暴区左侧下载飞船图纸，并完成飞船升级;最后，在飞船起飞前，携带风暴区中心 BOSS 掉落的密钥，前往地图右上角关闭防空导弹。当所有条件都满足后，最终结果是：玩家成功登上升级后的飞船，且飞船因防空导弹已关闭，没有遭遇任何攻击，顺利突破封锁，带着全员一起离开鸭科夫区域，成功完成逃离，达成 “逃离鸭科夫” 结局，这也是游戏中唯一实现 “全员安全撤离” 的结局。
