《宝可梦：Pokopia》发售首周销量突破220万份，亮眼的市场表现也拉动了任天堂股价。不过游戏中仍存在一些影响体验的问题。目前任天堂官方确认，将发布更新补丁以解决多个影响流程推进的常见BUG。
官方已知问题主要归因于游戏极高的自由度——玩家的自由操作有时会导致推进困难，甚至卡住流程。首轮补丁并不能全部解决已知问题，但将重点修复两大常见的流程阻塞：在荒凉海滩或荒野旷野的关键任务目标前如果替换了破损方块，更新后游戏会提供明确引导，避免玩家因此中断任务。
已知存在的问题包括：
荒野旷野任务“我们来建房子吧!”中，杰尼龟会卡在树上，玩家无法与其对话导致任务无法推进。
荒凉海滩任务“寻找宝可梦中心!”，如果玩家在巨蔓藤博士过桥前就破坏了桥梁的裂纹方块，会导致任务难以进行。
同样是该任务，在特定条件下，桥梁修复事件可能不会触发。
崎岖山镇中，某些操作可能导致无法触发遭遇洛托姆的事件。
崎岖山镇任务“我们来清理道路吧!”有时会出现难以继续的情况。
宝可梦图鉴中，线球的属性存在标注错误。
计划优化的项目：
荒野旷野“用碎石机打碎岩石!”任务，如果玩家在大岩蛇旁边的裂纹方块处放置了其他方块，将优化后续的推进提示。
荒凉海滩“带上博士一起出发!”任务，若在卡比兽附近的裂纹方块位置放置其他方块，也将优化提示逻辑。
本次用于修复问题的更新将于近期发布，即使已经遇到BUG的玩家，安装更新后问题也能得以解决。对于尚未提及的其他问题，官方表示会持续跟进调查。
目前官方没有公布关于新内容的消息。但游戏首个活动已确认为围绕“毽子草”展开的《给毽子草更多孢子》。首个补丁的发布时间尚未公布，仅说明将在“近期”推出。
